В империи Акацураи самураи и ниндзя столкнулись с революцией — Ёритомо провозгласил себя сёгуном, а Киёмори удерживает власть на западе. Игрокам предстоит выбирать между двумя фракциями, не позволяющими друг другу перейти к открытому конфликту. В их распоряжении — возврат жемчужины тацу и исследование Леса Квайлан с его тайнами.